掃描電鏡結構設計合理
掃描電鏡的分辨率介于光學顯微鏡和透射電子顯微鏡之間，但在對厚塊試樣的觀察進行比較時，因為在透射電子顯微鏡中還要采用復膜方法，而復膜的分辨率通常只能達到10nm，且觀察的不是試樣本身。因此，用掃 描電鏡觀察厚塊試樣更有利，更能得到真實的試樣表面資料。
觀察試樣的各個區域的細節。試樣在樣品室中可動的范圍非常大，其他方式顯微鏡的工作距離通常只有2-3cm，故實際上只許可試樣在兩度空間內運動，但在
掃描電鏡中則不同。由于工作距離大（可大于20mm）。焦 深大（比透射電子顯微鏡大10倍）。樣品室的空間也大。因此，可以讓試樣在三度空間內有6個自由度運動（即三度空間平移、三度空間旋轉）。且可動范圍大，這對觀察不規則形狀試樣的各個區域帶來極大的方便。
掃描電鏡在大視場、低放大倍數下觀察樣品，用掃描電鏡觀察試樣的視場大。在掃描電鏡中，能同時觀察試樣的視場范圍F由下式來確定：F=L/M式中 F——視場范圍；M——觀察時的放大倍數；L——顯象管的熒光屏 尺寸。若掃描電鏡采用30cm（12英寸）的顯象管，放大倍數15倍時，其視場范圍可達20mm，大視場、低倍數觀察樣品的形貌對有些領域是很必要的，如刑事偵察和考古。
進行從高倍到低倍的連續觀察，放大倍數的可變范圍很寬，且不用經常對焦。掃描電鏡的放大倍數范圍很寬（從5到20萬倍連續可調），且一次聚焦好后即可從高倍到低倍、從低倍到高倍連續觀察，不用重新聚焦， 這對進行事故分析特別方便。
因電子照射而發生試樣的損傷和污染程度很小。同其他方式的
掃描電鏡比較，因為觀察時所用的電子探針電流小，電子探針的束斑尺寸小，電子探針的能量也比較小，而且不是固定一點照射試樣，而是以光柵狀掃描 方式照射試樣。因此，由于電子照射面發生試樣的損傷和污染程度很小，這一點對觀察一些生物試樣特別重要。
在掃描電鏡中，成象的信息主要是電子信息，根據近代的電子工業技術水平，即使高速變化的電子信息，也能毫不困難的及時接收、處理和儲存，故可進行一些動態過程的觀察，如果在樣品室內裝有加熱、冷卻、彎 曲拉伸和離子刻蝕等附件，則可以通過電視裝置，觀察相變、斷烈等動態的變化過程。
